蛋白质工程是生物工程专业的一门专业选修课程。 蛋白质工程常被称为第二代基因工程，是以蛋白质的结构-功能研究为基础，运用基因工程技术定向改造天然蛋白质，或设计创造全新蛋白质。本课程系统介绍蛋白质工程领域的相关基础知识、主要方法和技术以及该方面的最新进展与具有典型意义的研究实例。 该课程教学的组织方式包括两大部分：基本理论课、讨论课。基本理论课采用传统教学与多媒体相结合手段。讨论课将通过学习和设计实际问题的解决方案等，使学生加深对基本原理的理解，并在此基础上强化学生解决实际问题的意识、提高其创新能力。加强平时课堂的提问、抽查、讨论，目的是通过鼓励学生自主学习，培养学生的自学能力和逻辑思维能力，促进素质和能力的全面发展。