农业微生物学是农业科学领域中的重要学科，有其独特的研究方法和操作技术，这些方法和技术已渗透到了农业科学的各个领域，因而在农业、植物保护、园艺、能源、环保等众多方面均发挥着重要作用。从我校建校之初，在农学、植保、园艺、设施农业、植保（农药）等专业均开设了这一课程。每年学习微生物课程的学生人数400人左右与其相关类似的课程有环境微生物学，微生物学，应用微生物学等。本课程发展历史悠久，授课范围广，曾被评为教育部重点建设学科和校级精品课程。本课程师资力量雄厚，现任教师6名，教授1人，副教授3人，讲师1人，实验师1人，具有博士学位4人，在读博士1人。微生物实验室设施齐全，拥有仪器设备400件，共计390余万元。